华佗（林文龙）自(zi)幼聪慧过人、醉(zui)心(xin)医(yi)学，因缘际(ji)遇下(xia)，拜名医张仲景为师。一次，关云长(zhang)（尹扬明(ming)）带同乡求(qiu)医，佗发现(xian)此人的(de)病症有异，不是普(pu)通伤寒，故将《伤寒论》和(he)《滋(zi)阴(yin)论》结合，成功研究出治(zhi)疗瘟疫之(zhi)法(fa)。惜百姓迷信鬼神(shen)之说(shuo)，加上小人得(de)志(zhi)，对(dui)佗诸多加害，令其惹上(shang)杀(sha)身之祸(huo)。时(shi)景之长女张妙心（伍咏(yong)薇），与佗两情相(xiang)悦，决心下(xia)嫁并随夫逃(tao)亡。
　　佗移居许昌后有医无类，不论(lun)病得多(duo)重(chong)的人也全力拯(zheng)救，结果往往失败(bai)，被评(ping)为「医死人大夫」，生活每况愈下(xia)。后(hou)佗替曹(cao)操（黄日华(hua)）的幼儿医好多年顽疾，得(de)操赏识(shi)，封为(wei)太医院(yuan)监，着手撰(zhuan)写医(yi)学(xue)大全。好景不常，操的奸雄本色渐露，命佗制毒药杀害关之(zhi)士兵，佗不耻操(cao)所为，投靠关。操头(tou)风病发作，老羞成(cheng)怒，以斩杀太医院内三百余(yu)人(ren)作胁，迫(po)佗返回(hui)许(xu)昌为其治病，佗深(shen)知此行凶(xiong)多吉少，莫非这就是命(ming)运的安排(pai)？